MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlorobium phaeobacteroides DSM 266 chromosome

Total Repeats: 10751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008639	TGG	2	6	1540	1545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008639	T	7	7	1558	1564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008639	TTC	2	6	1605	1610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008639	AAT	2	6	1611	1616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008639	ATGC	2	8	1739	1746	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_008639	TTTTA	2	10	1793	1802	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008639	CAA	3	9	1850	1858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008639	ACA	2	6	1861	1866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008639	TAA	2	6	1876	1881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008639	T	6	6	3128	3133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008639	CAATA	2	10	3141	3150	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_008639	TAT	2	6	3174	3179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008639	A	7	7	3198	3204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008639	TTCT	2	8	3214	3221	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_008639	T	9	9	3270	3278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008639	AAT	2	6	3295	3300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008639	CAA	2	6	4740	4745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008639	AGT	2	6	4768	4773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008639	A	6	6	4781	4786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008639	AAG	2	6	4789	4794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008639	A	6	6	4799	4804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008639	ATCCA	2	10	4919	4928	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_008639	TTC	2	6	4960	4965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008639	GCT	2	6	4985	4990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008639	A	8	8	5069	5076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008639	CCAA	2	8	6757	6764	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008639	TGC	2	6	9265	9270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008639	CT	3	6	9286	9291	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_008639	TAACT	2	10	9301	9310	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_008639	TCC	2	6	9944	9949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_008639	TGTT	2	8	9950	9957	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008639	GAA	2	6	9968	9973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008639	AAAT	2	8	9991	9998	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008639	AAC	2	6	10027	10032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008639	AGC	2	6	10089	10094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_008639	ACC	2	6	10227	10232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_008639	ATA	2	6	11639	11644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008639	AAT	2	6	12594	12599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008639	A	6	6	12613	12618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008639	TTATT	2	10	12643	12652	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008639	ACA	2	6	12662	12667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008639	AAGAC	2	10	14270	14279	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_008639	CT	3	6	14337	14342	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008639	TCT	2	6	15505	15510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008639	ATT	2	6	15528	15533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008639	TC	3	6	15554	15559	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008639	GA	3	6	15568	15573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008639	A	6	6	15626	15631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008639	AAT	2	6	15649	15654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008639	T	7	7	15682	15688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008639	ATCC	2	8	15701	15708	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008639	TGA	2	6	15716	15721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008639	TCT	2	6	15725	15730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008639	TATT	2	8	15742	15749	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008639	A	7	7	15753	15759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008639	ATTA	2	8	15776	15783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008639	ATAAA	2	10	15827	15836	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008639	A	10	10	15834	15843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008639	TTG	2	6	15888	15893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008639	CAT	2	6	15918	15923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008639	AGAA	2	8	15979	15986	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008639	AAT	2	6	16067	16072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008639	A	6	6	16086	16091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008639	TTATT	2	10	16116	16125	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008639	ACA	2	6	16135	16140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008639	AAGAC	2	10	17743	17752	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_008639	CTT	2	6	18629	18634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008639	ACAA	2	8	18670	18677	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_008639	ACA	2	6	18689	18694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008639	TAA	2	6	18799	18804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008639	AAC	2	6	18826	18831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008639	T	6	6	18920	18925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008639	ATG	2	6	18985	18990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008639	ATGAT	2	10	19026	19035	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008639	ATC	2	6	19081	19086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008639	CAT	2	6	19097	19102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008639	A	8	8	19115	19122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008639	A	6	6	19201	19206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008639	TTGA	2	8	19279	19286	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008639	A	6	6	19289	19294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008639	ATC	2	6	19347	19352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008639	TAT	2	6	19445	19450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008639	GT	3	6	19456	19461	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008639	CGT	2	6	19540	19545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008639	GAA	2	6	19807	19812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008639	TAAA	2	8	19880	19887	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008639	GCC	2	6	19916	19921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_008639	AAC	2	6	19925	19930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008639	TCGT	2	8	19942	19949	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_008639	TGAG	2	8	19996	20003	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008639	T	6	6	20047	20052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008639	CTT	2	6	20061	20066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008639	AAT	2	6	20107	20112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008639	CT	3	6	20165	20170	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_008639	T	6	6	20297	20302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008639	TTCC	2	8	20392	20399	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_008639	ATC	2	6	20402	20407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008639	A	6	6	20441	20446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008639	AAAC	2	8	20542	20549	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_008639	TCTT	2	8	20566	20573	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_008639	TCC	3	9	20591	20599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_008639	CAA	2	6	20656	20661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008639	GAAT	2	8	20669	20676	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008639	GA	3	6	20737	20742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008639	ATA	2	6	20746	20751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008639	ATT	2	6	20772	20777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008639	TGT	2	6	20821	20826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008639	T	7	7	20838	20844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008639	CCT	2	6	22214	22219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_008639	ATA	2	6	22223	22228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008639	AGG	2	6	22236	22241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008639	ATC	2	6	22272	22277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008639	CAC	2	6	22289	22294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_008639	ACC	2	6	22341	22346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_008639	GCT	2	6	22359	22364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008639	TTG	2	6	22374	22379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008639	ACA	2	6	22418	22423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008639	TTGT	2	8	22441	22448	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008639	TTGG	2	8	22483	22490	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008639	TTA	2	6	22518	22523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008639	TCA	2	6	22693	22698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008639	TCA	2	6	22738	22743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_008639	TGG	2	6	22751	22756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008639	GGGT	2	8	22761	22768	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008639	CAGAA	2	10	22773	22782	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_008639	AG	3	6	22794	22799	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008639	GCT	2	6	22827	22832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008639	CTC	2	6	22908	22913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_008639	TGT	2	6	22914	22919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008639	TGA	2	6	22934	22939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008639	T	7	7	22972	22978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008639	AAG	2	6	24271	24276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008639	CAG	2	6	24341	24346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_008639	GATT	2	8	24347	24354	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008639	ACG	2	6	24378	24383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_008639	ATA	2	6	24388	24393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008639	TTC	2	6	24395	24400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008639	CATG	2	8	24468	24475	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_008639	GGAA	2	8	24489	24496	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008639	TCAA	2	8	24526	24533	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_008639	GTT	2	6	26973	26978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008639	AGA	2	6	27125	27130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008639	AACC	2	8	27233	27240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_008639	CAT	2	6	27285	27290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_008639	T	8	8	27303	27310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008639	CTGA	2	8	27330	27337	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_008639	GTT	2	6	29213	29218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008639	TTG	2	6	29233	29238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008639	AAT	2	6	29272	29277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_008639	AAC	2	6	29370	29375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_008639	TTG	2	6	29376	29381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_008639	TA	3	6	40447	40452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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